У серпні 1948 року З. Комарницького було призначено вчителем Буковинської початкової школи (у її філіал переділку Зворець), а в листопаді того ж року його перевели на посаду завідуючого і вчителя Задільської початкової школи. Одночасно Зіновій Андрійович вступив на заочне навчання до Самбірського педагогічного училища (нині Самбірський державний педагогічний коледж імені Івана Филипчака).
З серпня 1949 року Зіновій Андрійович у Задільській школі, яка переводилась на 7-річну, почав викладати математику і фізику.
У 1950 році юнак не лише закінчив педагогічне училище, а й вступив до молодіжної організації українських націоналістів (ОУН), зв'язавши свою долю з повстанською армією.
Проте вже 11 листопада 1950 року Комарницького Зіновія Андрійовича арештували. Сталося це посеред робочого дня, на перерві після третього уроку. Дев'ятнадцятирічний Зіновій був засуджений військовим трибуналом військ МВС Дрогобицької області за ст. 54-1 «а», 54-11 і 16-54-8 на 25 років ув'язнення, 5 років позбавлення громадянських прав з конфіскацією майна. Ув'язнення Комарницький З. А. відбував у місті Воркута, працюючи на підземних роботах вугільних шахт №7 і №29.